BioShock 2 продолжает историю первой части. Спустя 10 лет, вы снова вернетесь в подводный город Восторг, но на этот раз в роли «Большого Папочки», первого прототипа Субъекта Дельта с собственной волей. В 1958 году, София Лэмб убила «Дельту» и забрала маленькую девочку Элеонор. Спустя десять лет Дельта просыпается на берегу моря, и теперь постарается вернуть Элеонор из лап главного антагониста – психиатра Софии Лэмб, которая к этому времени стала лидером подводного города. С самого начала у вас будет только одно оружие – бур. По мере прохождения вы сможете улучшать возможности персонажа, а также находить новое оружие. Город, который хорошо многим известен по первой части, сильно изменился. Восторг превратился в ужасное разваливающееся место, где для выживания, ты сам должен убивать.